Скуби-Ду и его верные друзья неожиданно оказываются внутри видеоигры, созданной по мотивам их собственных приключений. В процессе преследования хитроумного противника, команда проходит через десять невероятно сложных уровней. Их путь пролегает от доисторических эпох до далекого космического будущего, где им предстоит встретиться с множеством виртуальных чудовищ, каждое из которых воплощает самые известные ужасы из их прошлых расследований.
Шэгги и Скуби-Ду вместе с друзьями отправляются в путешествие, которое внезапно прерывается в каменистой пустыне. Над их головами зависает странный аппарат, напоминающий летающую тарелку, и их автомобиль врезается в огромный кактус. К счастью, авария происходит рядом со станцией слежения за космическими сигналами. Но было ли это действительно случайностью? Оказывается, эта местность давно славится дурной репутацией, а рассказы об инопланетянах, похищающих людей, стали частью местного фольклора.