Таинственный человек в маске, известный как Учиха Мадара, замышляет захватить силу девятихвостого демона. Для реализации своего плана он проникает в деревню Коноха, где встречает Наруто и Сакуру. Используя свои способности, он создаёт альтернативную реальность, в которой родители Наруто живы, а Саске возвращается в деревню. Герои вынуждены преодолевать множество испытаний, чтобы вернуть всё на свои места и остановить коварного врага. В этом мире они узнают истинную ценность дружбы и
В мире Наруто незаметно пролетели два года. Бывшие новички пополнили ряды опытных синоби в ранге тюнин и дзёнин. Главные герои не сидели на месте - каждый стал учеником одного из легендарных наставников. Наруто, обладающий неугомонной энергией, упорно тренируется под руководством Джирайи, мечтая вернуть друга Саске, который ушел к Орочимару. Тем временем, Акацуки активизировали свои действия, стремясь захватить силы биджу. На фоне этих событий разворачивается эпическая борьба добра и зла.
История повествует о юных ниндзя, только что завершивших обучение в академии и получивших свои первые повязки, символизирующие их новый статус. Сразу после выпуска они сталкиваются с миром, полным испытаний и опасностей. Главный герой, обладающий неуемной энергией и мечтой стать величайшим ниндзя, вместе с друзьями отправляется на выполнение различных миссий. В ходе своих приключений они не только совершенствуют свои боевые навыки, но и узнают о дружбе, преданности и истинном значении силы.
Эйкити Онидзука, эксцентричный и энергичный преподаватель, становится классным руководителем проблемного класса «три-четыре» в частной «Академии Священного Леса». Своими нестандартными методами и неподражаемым подходом к воспитанию, он бросает вызов устоявшейся системе образования. Онидзука не только справляется с хулиганами и трудными подростками, но и помогает им найти себя, преодолеть личные трудности и поверить в собственные силы.