Трое юных искателей приключений отправляются в море на поиски пропавшего рыбака, но судьба преподносит им неожиданный поворот. Попав в мощный шторм, они оказываются выброшенными на таинственный остров, где обнаруживают секретную базу террористической организации «Красный Бамбук». Вокруг острова властвует гигантский краб Эбира, грозный и неумолимый. Однако, на помощь неожиданно приходит Годзилла, который оказывается поблизости и готов вступить в схватку с врагами, чтобы защитить остров и его
К концу 1999 года все гигантские монстры, включая Годзиллу, были пойманы и помещены на небольшой остров в Японии для изучения. Но внезапно группа инопланетян захватывает контроль над чудовищами, освобождая их и направляя против человечества. В ответ на эту угрозу команда астронавтов получает задание: найти и уничтожить базу злых пришельцев, прежде чем управляемые ими монстры разрушат города по всей планете.