Кубо — наследник великого рода, но когда возвратились духи прошлого, жаждущие мести, на его защиту отважилась встать лишь странная парочка хранителей. И теперь для Кубо единственный шанс на спасение — найти магические доспехи отца, легендарного самурая.
В центре сюжета одинокий подросток Колтон, который решает провести летние каникулы, присматривая за домом своего соседа. Однако его спокойствие нарушается, когда он замечает странную активность в соседнем доме, где живет молодая девушка Хизер. Постепенно Колтон начинает подозревать, что Хизер находится в опасности и решает выяснить правду. Вскоре он обнаруживает, что в доме скрывается мрачная тайна, связанная с оккультными ритуалами и древним злом, которое пробуждается с каждым днем.