Прошло два года с тех пор, как отважная команда, возглавляемая Клаудом Страйфом, предотвратила угрозу, исходящую от коварного Сефирота. В наступившем мире воцарился покой, а могучий Клауд решил отойти от дел и поселиться в уединении. Однако спокойствие оказалось мимолетным: новая угроза в лице таинственных братьев, стремящихся воскресить Сефирота, вновь нависла над планетой. Клауду предстоит вернуться в бой, чтобы защитить своих друзей и сохранить хрупкий мир.
У побережья острова Гуам при загадочных обстоятельствах терпит крушение американская подводная лодка. Адмирал Татибана убежден, что причиной катастрофы стал Годзилла, король всех монстров, который спустя почти полвека после первого нападения на Токио вновь возвращается, чтобы разрушить Японию. Его дочь Юрико, репортер популярной телепрограммы, стремится раскрыть правду, скрытую за тремя таинственными происшествиями в разных районах страны. Она встречает старика Исаяму, который рассказывает ей о