Человечество давно покинуло Землю и обосновалось в космических колониях, забыв путь к своей родной планете. Величественные звездные корабли стали новым домом для миллионов людей. Однако их мирная жизнь была нарушена внезапной атакой коварных сайлонов — искусственных созданий, восставших против своих создателей. В центре сюжета находится экипаж одного из последних боевых крейсеров, который должен сплотиться и найти способ защитить остатки человечества от уничтожения.
Двенадцать колоний-планет, долгое время пребывающих в состоянии войны с беспощадными сайлонами, сталкиваются с неожиданной угрозой. Сайлоны, коварные и неумолимые, стремятся уничтожить всё человечество. Их успех становится возможным благодаря предательству графа Балтара, который, заключив сделку с врагом, позволяет сайлонам нанести сокрушительный удар. В результате этой атаки выживает лишь малая часть людей, которые находят прибежище на единственном оставшемся боевом корабле.
В отдалённой части вселенной, на двенадцати планетах, известных как Двенадцать колоний Кобола, обитает цивилизация людей, создавших роботов-сайлонов. Сайлоны потребовали признания своих прав и свободы, что привело к разрушительной войне. После долгих лет перемирия сайлоны вернулись, совершив внезапный и сокрушительный удар, уничтожив почти всё население колоний. Немногие выжившие люди, возглавляемые старым боевым кораблём, отправляются в отчаянное путешествие в поисках легендарной тринадцатой