В морских просторах начинают исчезать японские суда, оставляя после себя лишь обрывки радиограмм, в которых упоминаются огненные столбы, вырывающиеся из глубин океана. Вскоре причина этих загадочных происшествий становится очевидной: на поверхность выходит древнее чудовище, разрушительное и неумолимое. Это существо, пробудившееся от долгого сна, сеет хаос и разрушение, угрожая человечеству. Научные умы и военные силы объединяются, чтобы найти способ остановить монстра и спасти мир от неминуемой
Небольшой японский городок превращается в руины после загадочной катастрофы. Военные начинают расследование и находят гигантского боевого робота, известного как Могера. Выясняется, что робот принадлежит инопланетной расе с планеты Мистероид. Эти пришельцы требуют у земных властей выделить им участок земли для строительства базы и развлечений с земными женщинами. Власти категорически отказываются, и тогда мистериане начинают полномасштабное наступление на человечество.